高效液相色谱（HPLC）是检测1,4-二甲氧基-2-硝基苯纯度的首选工具，可精确量化主峰面积，检测限达0.1%。配备UV检测器的型号如Agilent 1260系列适用于实验室常规分析。
气相色谱（GC）适用于挥发性杂质筛查，尤其在结合质谱仪（GC-MS）时，能鉴定硝基异构体。Thermo Fisher的Trace 1300系列提供高分辨率数据。
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红外光谱仪（FTIR）用于快速结构确认，通过特征峰如硝基伸缩振动（1520 cm⁻¹）验证化合物身份。便携式型号如PerkinElmer Spectrum T。