柠檬酸哌嗪水合物属非危险化学品，但运输需遵守UN标准。包装应使用双层塑料袋内衬纤维桶，确保防潮和防污染。标签需标明产品名称、批号和UN编号。
陆运中，选择专用化工车辆，避免与强酸碱共载。温度控制在0-30℃，防止结块或分解。途中需配备泄漏应急套件。
海运和空运需符合IMDG和IATA规定。集装箱内放置干燥剂，监控湿度以维持水合物稳定性。国际物流中，注意目的国进口限制，如欧盟REACH注册。
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风险防控包括定期检查包装完整性和GPS跟踪。发生泄漏时，使用吸收材料处理，避免环境污染。保险覆盖运输风险是B2B合同的必要条。