CNC机床制造的核心难点在于高精度组装。主轴和导轨的同心度需控制在微米级，任何偏差都会放大加工误差。采用激光干涉仪校准是标准做法。
热稳定性控制是另一挑战。机床运行中产生的热变形会影响精度，制造时需集成冷却系统和热补偿算法。材料选择如使用低膨胀合金有助于缓解。
数控系统的集成复杂性高。制造需确保硬件与软件的无缝对接，支持多轴联动。调试阶段往往耗时长，需专业团队协作。
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此外，振动抑制技术要求严格。高频振动会降低五金配件表面质量，制造中采用阻尼材料和动态平衡设计来优化。
供应链协调也是难点。关键部件如伺服电机需及。