GC-MS（气相色谱-质谱联用）是检测5-甲基-3-庚酮纯度的首选工具，能精确鉴定杂质峰。Agilent 7890系列仪器分辨率高，适用于ppm级分析。
HPLC（高效液相色谱）适用于极性杂质分离，配备UV检测器可快速量化。Waters Alliance系统操作简便，适合日常质检。
NMR（核磁共振）提供结构确认，Bruker Avance III设备分辨率优异，用于研发阶段验证。结合IR光谱可全面表征官能团。
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便携式工具如手持式FTIR光谱仪便于现场检测，Thermo Fisher的TruDefender适合物。