反-2-十二烯醛的纯度检测主要依赖气相色谱（GC）。Agilent 7890B型号配备FID检测器，可精确分离trans和cis异构体，定量准确率达0.1%。
核磁共振（NMR）仪如Bruker Avance III，用于结构确认。1H-NMR谱显示特征峰在6.1-6.5ppm，验证双键位置。
红外光谱（IR）作为快速筛查工具。PerkinElmer Spectrum Two显示C=O伸缩峰在1720cm⁻¹，辅助初步鉴定。
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对于现场测试，手持式近红外（NIR）光谱仪如Thermo Fisher MicroPhaz。