肉豆蔻酸乙酯为无色油状液体，运输时采用200L铁桶或IBC吨桶包装，内衬食品级PE膜以防渗漏。需贴危险品标签（UN 3082），符合IMDG规则。
陆运中，避免高温环境，车辆温度控制在25℃以下。长途运输建议使用恒温集装箱，防止氧化变质。
海运要求隔离易燃品，舱室通风良好。保险索赔需记录温度曲线，以应对潜在索赔。
储存仓库应阴凉干燥，远离火源和强氧化剂。货架高度不超过2米，定期检查密封性，每季度抽检一次。
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在能源行业应用中，储存期不超过12个月。采用FIFO原则，确保先进先出，维持产品活性。
物流优化可通过RFID追。